Discussion Committee:
د.غالب عدوان/ مشرفا رئيسا
د. حاتم عيده/ ممتحنا خارجيا
د. معتصم المصري/ ممتحنا داخليا
Supervisors:
د.غالب عدوان/ مشرفا رئيسا
Abstract:
البكتيريا الإشريكية القولونية هي واحدة من أكثر أنواع البكتيريا المسببة لإصابات الجهاز البولي. هذا المسبب المرضي مسجل في 50%-90% من كل إصابات الجهاز البولي غير المعقدة.
تهدف هذه الدراسة لتحليل المجموعات التطورية، والعوامل المسببة للمرض والمقاومة للمضادات البكتيرية في مجموعة من 50 عزلة من البكتيريا الاشريكية القولونية تم الحصول عليها من بول لحالات ربما تكون مصابة بإصابات في الجهاز البولي لمرضى مقيمين و غير مقيمين في المستشفى خلال الفترة ما بين شهر أيار و كانون الاول من عام 2012 م.
تم الكشف عن المجموعات التطورية وذلك باستخدام تقنية سلسلة تفاعل البلمرة المتعدد، أظهرت النتائج أن معظم العزلات التي تم دراستها وبشكل أساسي 63 عزلة (72%) تنتمي الى المجموعة (D)، 13 عزلة (26%) تم تحديدها في المجموعة (A)، بينما وجدت عزلة واحدة (2%) تنتمي للمجموعة (B1) ذات دلالة إحصائية (P < 0.001).
تم دراسة مقاومة عزلات بكتيريا الاشريكية القولونية بواسطة طريقة الانتشار القرصي. إن مقاومة المضادات تراوحت من 24% للجنتاميسين الى 100% للاريثرومايسين والسيفازولين. أظهرت هذة النتائج أن معدلات سجل النقاط لمقاومة المضادات الحيوية كانت 8.4 و 6.5 لسلالات المجموعتين D وA على التوالي، ذات دلالة إحصائية .(P = 6.2 x 10-4) إن انتشار مقاومة المضادات التي تم اختبارها في كل سلالة تراوحت من 14.3% الى 100%. تم التوصل الى أن 61.5% (8/13) من العزلات المنتمية للمجموعة التطورية Aكانت مقاومة ل 5 أو أقل من المضادات الحيوية بينما 66.7% (24/36) من العزلات المنتمية للمجموعة التطورية D كانت مقاومة ل 6 أو أكثر من المضادات الحيوية. كما واظهرت ارتباط مقاومة ترايميثوبريم/سلفاميثوكسازول بالمجموعة D التي كانت ذات فروق احصائية على .(P > 0.05) بين السلالات المقاومة للفلوروكينولونات والكينولونات كانت تكرارات مجموعات A ,D 75.0% (27/36) و 61.5% (8/13) ،على التوالي.
تمت دراسة الجينات الممرضة عن طريق تفاعل البلمرة المتعدد. أظهرت النتائج أن انتشار الجينات الممرضة تراوحت من 0% ل (papG allel1 ,hlyA) إلى 86% ل (fimH, traT) في السلالات التي تم فحصها. وكان انتشار الجينات الممرضة (utaA, iha, kpsMTII, usp, fyuA) 74%، 64%، 64%، 58%، و52%، على التوالي. وكان توزيع fimH 86.1% و84.6% في مجموعات A ,D على التوالي .إن انتشار الجينات التي تم اختبارها في كل سلالة تراوحت من 5.6% إلى 83.3%. أظهرت النتائج ان معدلات سجل النقاط للعوامل الممرضة للمجموعة D كان 8.2% وتراوح بين 2-15 بينما للمجموعة A كان 6.2 وتراوح بين 1-14 وكان ذا دلالة إحصائية .(P = 6.2 x 10-4) كما وأظهرت النتائج أن 69.2% (9/13) من السلالات كانت تنتمي للمجموعة التطورية Aوحملت 6 أو أقل من العوامل الممرضة، بينما 66.7% (24/36) من السلالات كانت تنتمي للمجموعة التطورية D، وحملت 7 أو أكثر من العوامل الممرضة. إن السلالات الحساسة لكل من الفلوروكينولونات والكينولونات والمتعلقة بالمجموعة التطورية D أظهرت ارتفاعا مهما في انتشار الجين الممرض iroN أكثر من المقاومة. بينما في المجموعة التطورية A ارتفع انتشار papG2 وانخفض انتشار fimH للسلالات الحساسة لكل من الفلوروكينولونات والكينولونات. بالمقارنة بين السلالات المقاومة والحساسة لكل من الفلوروكينولونات والكينولونات بغض النظر عن المجموعات التطورية أظهرت السلالات الحساسة ارتفاعا مهما في الجين الممرض .ompTيبدو انه ليس هناك عامل ممرض واحد أو نمط محدد لالتهاب المسالك البولية. أظهرت النتائج أن 3 عناقيد كبيرة تعتمد على وجود/غياب العوامل الممرضة cnf1و afa/draوليست على المجموعات التطورية. تم التوصل أيضا الى ان جين traTكان الأكثر انتشاراً بين السلالات المقاومة لحمض الناليديكسيك، الفلوروكينولونات وترايميثوبريم/السلفاميثوكسازول وكان 90.1% (30/33) و95.8% (23/24) و90.6% (29/32)، على التوالي .
وفي النهاية اظهر التحليل الجزيئي ل 50 عزلة بكتيريا اشريكية قولونية بولية انتشاراً واسعاً للمجموعات التطوريةD ، معدلات سجل النقاط للعوامل الممرضة ولمقاومة المضادات مرتفعة أكثر من المجموعة .A إن إصابات الجهاز البولي الناتجة عن هذه السلالات تمثل مشكلة سريرية بسبب الخيارات العلاجية المحدودة . بالإضافة إلى ذلك، مزيد من التحليل يجب إجراؤه خاصة داخل الكائن الحي باستخدام سلالات متحولة أو المنتج من هذه الجينات للكشف عن أهمية وتأثير العوامل الممرضة بخصوص الأعراض السريرية.